1997年,超级电脑炼金之星预测到地球将会破坏招来体所消灭。得知此事后人类用炼金之星的研究技术组成一个全球防御组织GUARD,而XIG则是GUARD的战斗力量。
2000年,天才少年·高山我梦在一次试验中见到神秘的红色光之巨人。当破坏招来体第一次进攻的时侯,XIG起不到作用。此时,我梦坠入光之隧道,并再次看见巨人,他希望巨人能赐予力量保卫地球。于是,巨人与我梦合二为一,并与破坏招来体展开了战斗。
在战胜破坏招来体之后,我梦加入了XIG,而巨人则被命名为“盖亚”。但此时,另一名青年·藤宫博也亦拥有着变身成巨人“阿古茹”的力量。两个巨人与破坏招来体将会展开一连串的战斗。
八王子市发生一起凶杀案,数名男女身体被树枝贯穿而死,现场仅留下一名失去记忆的女高中生黑井美沙.
调查神秘失踪事件的记者城户真司,被一只怪兽拉进镜内。在镜世界中,真司为假面骑士龙骑·榊原耕一所救,但榊原也身负重伤。临终前榊原把变身卡盒和13骑士名单托付给真司,希望真司能够阻止骑士大战。逃出镜世界后,真司开始寻找名单上的骑士们……
本特别篇有两个结局,在首播时以电话投票形式让观众决定最终结局的走向。
在一座全封闭且空无一物的工厂里,美丽的少女有菌铃音(吉井怜 饰)从昏迷中醒来。她是一名拥有寄生虫专业知识的兽医学博士,此前一直在追查一种可以令人纵情淫乐的神秘寄生虫。与操纵寄生虫的邪恶组织鬼头财阀的大战以及关于父亲的记忆相继浮现脑海,而此时她发现隶属鬼头财阀的高哉(高野八诚 饰)也被囚禁在这里。二人尝试逃脱,却不断遭到一群丧失心性的男女的袭击……
本片根据漫画家春辉的原作改编。
超人佳亞從「根源破壞招致物體」手上拯救了地球之後,高山我夢(超人佳亞)重回到城南大學的校園,過著平靜的每一日。他現在擁有的變身器Esplander也已經失去了超人的光茫。
一方面地球又開始受某些東西的侵略了……。我夢再次被特種迎戰保衛隊XIG召集。終於,根源破壞海神Gakuzomu、根源破壞飛行魚Rozan出現了。究竟失去了超人的光茫的高山我夢和藤宮博也能否取回超人的光茫?而地球的命運又會如何?